Pedofilinin teşhisinde birtakım zorluklar vardır. Hastalığa sahip kişiler, nadiren gönüllü olarak danışmanlık yardımı ararlar ve tedavi genellikle mahkeme kararı sonucunda olmaktadır. Suç soruşturması ile elde edilmiş görüşmeler, gözetim altında tutma veya internet kayıtları, durumun teşhisinde yardımcı kanıtlar olabilirler.
Bu şahısların genellikle psikiyatrik hastalıkları da taşıdığı görülmektedir. Anksiyete, major depresyon, bipolar ve unipolar depresyonlar ve madde bağımlılığı en sık görülen hastalıklardır.