Padua'daki geniş bir ayaklanam üzerine suçlanan Negri, 1977 sonlarında bu suçlamalardan aklanıp Padua'ya döner; ama 1978-1979 yıllarında zamanının çoğunu Paris'te Ecole Normale'de geçirir.
Nisan 1979'da Milan'a geri dönen Negri, Aldo Moro'nun Kızıl Tugaylar tarafından kaçırılıp öldürülmesi sonrasında açılan soruşturma çerçevesinde niteliği belirsiz suçlamalarla tutuklanır.