Zaman içerisinde Doğu Türkistan'daki Çin hâkimiyetine karşı isyanlar çıkmıştır. Mesela Yakub Han 1870'te İngilizlerle de anlaşır, Osmanlı'dan da yardım ister, İstanbul'a Kaşgar elçisi gelir. 1872'den itibaren Yakub Han'ın hâkim olduğu Kaşgar'da ve diğer yerlerde hutbeler Osmanlı padişahı Abdülaziz adına okunur yani Osmanlı etkisi oralara ulaşır. Fakat tüm bu çabalar, mücadeleler Çinlilerin işgalini engellemez.