İkinci Viyana kuşatmasının ardından bölge tamamen elimizden çıkınca buraya gelen Fransisken rahipler 1689'da türbeyi kiliseye çevirmek istediler. Ardından Sigetvar'a Cizvitler geldi. Pater Frantzel, Kanuni'nin türbesini takdis ederek, Hazreti Meryem'e ithaf etti. Türbenin yanındaki camide ayinler yapıldı.1693'te ise Gallo Tesch isimli bir iaşe subayı türbeyi amirlerinin haberi olmadan yıktırıp, kubbedeki kurşunlanı aldığı gibi altın yaldızlı yuvarlağı da Viyana'da satılması için gönderdi.
Bu durum üzerine soruşturma açıldı. Sigetvar komutanı Kont Vecchia Viyana'ya gönderdiği raporunda "Bu muhteşem binayı barbarca yıktırmak ne ayıp, bunun sadece mermer taşları binlerce lira kıymetindeydi" diye yazmıştı. Harp meclisi tahkikat sonucunda türbeyi yıkan subayı tazminata mahkûm etti.
Türbenin üzerine de bir Katolik kilisesi inşa edildi.