Müjgan Çakır, Araştırma & Başvuru Kitapları, Başvuru Kitapları, Deneme kategorilerinde eserler yazmış popüler bir yazardır.
Başlıca kitapları alfabetik sırayla; 16. Yüzyıldan Bir Aşk Hikayesi, Bu Alamet ile Bulur Beni Soran Fuzuli Kitabı, Gazelden Gazele: Dünün Şiirine Bugünden Bakışlar, Hicve Reva, Mizaha Mayil Güldürücü Metinleri Anlamak - Eski Türk Edebiyatı Çalışmaları 13, Mesnevi - Hikayenin Şiiri, Metin Neşri: Problemler, Tespitler, Öneriler olarak sayılabilir.
Müjgan Çakır kitapları; Kesit Yayınları, Kitabevi Yayınları, Klasik Yayınları, Turkuvaz Kitap aracılığıyla kitapseverlerle buluşmuştur.
Müjgan Çakır tarafından yazılan son kitap "Mesnevi - Hikayenin Şiiri", Turkuvaz Kitap tarafından okurların beğenisine sunulmuştur.