1967 yılında Niğde’de doğdu. İlk, orta ve lise öğrenimini Ankara’da tamamladı. 1989 yılında Orta Doğu Teknik Üniversitesi (ODTÜ) Siyaset Bilimi ve Kamu Yönetimi Bölümü’nden mezun oldu. 1996 yılında Uluslararası İlişkiler (ODTÜ) alanında yüksek lisans, 2002 yılında ise Siyaset Bilimi (ODTÜ) alanında doktorasını tamamladı. Dr. Gündoğan’ın Amerikan Yüzyılı: Amerika Birleşik Devletleri’nin Yükselişi ve 11 Eylül 2001 (Liberte Yayınları, 2008) başlıklı bir kitabı ile siyaset bilimi ile uluslararası siyaset alanlarında çeşitli makale ve tercüme eserleri bulunmaktadır
Modern dünyanın siyasi rejimleri arasında en kırılgan ve dolayısıyla devrimci tehdide en açık rejimler monarşilerdir çünkü toplumsal hoşnutsuzluklar bu sistemlerde tek bir kişinin üzerinde kolaylıkla yoğunlaşabilir ve toplumsal nefretin odağına monarkların bizzat kendileri oturabilir
İran, ABD ve Sovyetler Birliği'ni büyük ve küçük şeytan olarak nitelemesine, İsrail'i tamamen hedef tahtasına oturtmasına rağmen, ABD ile hem de İsrail aracılığıyla silah alışverişinde bulunmuştur.