Aile içindeki problem çözülmüş olsa da gerilim henüz bitmemişti. Şemsi Efendi Okulu Selanik’te büyük eleştirilere maruz kalmıştı. Okul, öğrencilerine Batı yöntemiyle Batılı bir eğitim vereceği konusunda açık davranıyordu. Okul ortamına katı bir disiplin hakimdi. Personel ve öğrenciler birbirlerine asker selamı vermek de dahil askeri görgü kurallarını uyguluyordu. Müslüman cemaat içindeki gelenekçiler okula ve okulun sembolize ettiği değerlere karşı çıkıyordu. Okul tesadüfen, Selanik’te eğitim devrimini gerçekleştiren Müslüman-Sabetayist bir cemaat olan Dönmelere aitti. Okulun bu mezhebe ait olması okula karşı muhalefeti kayda değer biçimde etkilemişti. Okulun ilk yıllarında (ara sıra şiddet içeren) toplantılar ve eylemler gerçekleşmiş, bunlar okulun kısa süreliğine kapanmasına sebep olmuştu.