Gizli Emir, adı ve coğrafyası belli olmayan bir şehir (Roman kişilerinin Türkçede kullanılan adları dışında) halkının, kimden ve nereden geleceği belli olmayan bir ‘gizli emir’
bekleyişi sürecindeki gerginliğini anlatır. Roman, “Sessizlik kocaman bir göktaşı gibi oturmuştu kentin üstüne; bu yüzden şaşkına dönen insanlar birbirlerinin yüzlerine bakıyorlar,
uyuyan bir canavarı uyandırmaktan korkarmışçasına ayaklarının ucuna basarak yürüyorlardı sanki” (s. 7)
cümlesiyle bu belirsiz bekleyişin kaotik ortamını anlatıyor. Baskıcı bir örgüt olan AYOT’un insan temel
hak ve özgürlüklerini yok sayarak her şeyi kontrol altına aldığı bir kentte geçiyor.
Bu belirsizlik nedeniyle Gizli Emir anti-ütopya veya Baskıcı bir yönetimin insanları zaptırapt altına alışları ve
aydınların ve kentlilerin halini anlatıyor...