Ergenekon davasının ilk iddaanamesi Temmuz 2008 ayı sonuna doğru yayınlanacak ve kamuoyu yapılan tutuklama ve gözaltıların Ergenekon isimli bir belge yüzünden olduğunu ilk kez o zaman öğrenecekti. Buna rağmen Nisan 2008 ayında Taraf yazarları rahatlıkla Ergenekon örgütünden bahsedebilmekteydiler.