Babanzade Naim rektörü olduğu Darülfünun'a bağlı Darülmuallimat (Kız Yüksek Öğretmen Okulu) müdür ve öğretmenlerine Ankara'dan gelen emir gereği "Başınızı açın" dememek için istifa etti.
Son senelerde akıbeti daha çok düşündüğüm için; "Ya Rabbi akıllı, hafızalı, sağlıklı, ibadetli, izzetli, ikramlı bir hayat, son nefesimize kadar kendi hizmetimizi rahatlıkla tertemiz yapabilme gücü, beş vakit namazımızı erkanıyla kılabilmeyi ve kendi aldığım abdestle iman-ı kâmille göçmeyi nasip eyle, çekmeden, çektirmeden, iğrenilecek, utanılacak, acınacak durumlara düşmeden Rasulullah'ın (sav) cemâl-i şerifini göre göre, rahatlıkla kelime-i şahadet getire getire son nefesimi, iman-ı kâmille Medine'de teslim etmeyi nasip eyle ya Rabbi" diye dua ediyorum.