1912 Balkan Savaşı'nda okulun bir kısmı cepheden gelen yaralıların bakımı için Kızılay'a verildi. Osmanli Devleti'nin 1914’de Birinci Dünya Savaşina katılması ve Fransa ile savaş halinin başlaması üzerine okul 1919 yılma kadar kapalı bulunacaktı.
Saint Joseph Lisesi