Jüpiter atmosferindeki su miktarı,gezegenbilimciler açısından önemli bir
veri; zira Güneş Sistemi'nin oluşumu
hakkında ipuçları içeriyor. Jüpiter’in
oluşan ilk gezegen olduğu varsayıldığından, Güneş’te bulunmayan birçok gaz ve tozun da burada olduğu düşünülüyor. Jüpiter’in oluşumuna dair teorilerin bazıları, gezegenin emmiş olduğu su miktarına dayalı. Su miktarı ayrıca gaz devinin meteorolojik özellikleri
(örneğin rüzgarlarının nasıl estiği) ve iç
yapısı hakkında da ipuçları veriyor. Voyager ve diğer uzay araçları, Jüpiter’de (nem oranına bağlı bir doğa olayı olarak) yıldırımlar gözlemlemişler, bu da atmosferde su varlığının bir göstergesi olabilir.
