Çaka'nın Bizans'a yönettiği bu geniş askeri harekatı, Çanakkale ve yörelerini kendi yönetim sahasında gören Türkiye Selçuklu sultanı olan damadı I.Kılıçarslan ile Bizans imparatoru Aleksios Komnenos'un dikkatlerinden uzak kalmıyordu. İmparator, bir yandan, Dalassenos'u yeni bir donanmayla İzmir'e sevk ederken, öbür yandan da sultan Kılıçarslan'a bir elçi göndererek onu, Çaka'ya karşı kışkırtmak suretiyle, ittifakını sağlamayı başardı. Bu antlaşma ve ittifakın böylece gerçekleşmesinden hemen sonra, bir yandan Kılıçarslan'ın karadan, öbür yandan da Bizans'ın denizden tehdit ve saldırıları karşısında ciddi bir tehlikeye düşen Çaka Bey, rivayete göre, Abidos yakınlarında bulunan sultana ziyarete gittiği zaman, bir şölen sırasında öldürüldü (1093).