Hüdâyî'nin Cüneyd Bağdâdî neslinden geldiği; hatta “seyyid" olduğu rivayet edilir. Nitekim o şiirlerinde:
Ceddim u pîrim sultan Sensin ya Rasûlallah
diyerek Hz. Peygamber'in, kendi ceddi bulunduğunu belirtir. Ayrıca Tecelliyât adlı eserinde manevi işaretlerle kendisinin vâris-i nebî olduğu ifadelerine yer verir. Ancak bu verâset, sulbî olabileceği gibi manevi de olabilir. Nitekim Peygamberimiz (s.a.s.): “Ben size babanız makamındayım." buyurmakla manevi nesebin varlığına ve peygamberlerin ümmetlerinin manevi babaları olduğuna işaret etmektedir.
Hüdâyî'nin sadık müridlerinden Kaptan-ı Deryâ Sadrazam Halil Paşa'nın vakfiyesinde Hüdâyî'den bahsedilirken kullanılan ifadeler, devrinden itibaren Hüdâyî'nin “seyyid” olarak anıldığını göstermektedir.