Mustafa Kemal ile Bâb-ı Ali arasındaki ilişkilerin resmen bozulması ise İzmir'deki Reddi İlhak Cemiyeti'nin faaliyetleri dolayısıyla oldu. Bu cemiyet dört bir yana gönderdiği telgraflarla direnmeyi teşvik edici haberler yaymaya devam ediyordu. Bu eylemin geniş çapta çarpışmalara yol açabileceğini, bu durumda da Paris görüşmeleri esnasında kötü etki yapacağını düşünen Dahiliye Nazırı Ali Kemal, bu tür telgrafların kabul edilmemesini, zorla kabul ettirilse dahi çekilmemesini Refik Halit'e (Karay) 16 Haziran'da tamim ettirdi. Ali Kemal, 18 Haziran' da bir genelge daha yayımlıyordu. Buna göre Osmanlı Hükümeti, "her türlü hukuk hilafına ve zalimane bir şiddetle" yapılan işgallerden ne denli üzülürse üzülsün, şu dakikalarda savaşacak halde değildi. Tek savunması siyasal yoldandı. Şükür ki konferansta yurdun bütünlüğünün sağlanabileceği umutları günden güne artmaktaydı.