Kardeşler, Yaralı Yüz'ün saldırısından sonra Edward mekanik kolunu kaybeder. Kolunu tamir ettirebilmek için memleketlerindeki Winry Rockbell'i ziyaret etmeye karar verirler. Ordu kardeşleri korumak için yanlarına Alex Louis Armstrong'u verir. Memleketlerindeki sahnelerin çoğu duygusaldı.
Tedavi sürecinden sonra kardeşler felsefe taşı için arayışa devam ederler. Bu arayış onları Taş’ın gizli formülünün saklı olabileceği büyük ve gizli bir merkeze götürür. Bu merkezde kardeşleri, Taşın formülünü korumakla görevli muhafızlar beklemektedir...