Pinkerton, Konfederasyon güçlerinin durumunu değerlendirmektense, kendi ününü arttırmak konusunda hep daha başarılı olmuştur. Lincoln, bir suikast sonucu öldürülmesinden önce katıldığı son Bakanlar Kurulu toplantısı sırasında nihayet, Amerika Birleşik Devletleri Gizli Servisi adını taşıyan federal bir teşkilatın kuruluşunu gerçekleştirdi. Bu işlemi yaparken Kongre'ye danışmamış, yalnızca bir Başkanlık Emri yayınlamakla yetinmişti. Zira, o sırada ülkedeki iç savaş henüz sona ermemişti ve dolayısı ile Lincoln, yayınladığı emrin kabul edileceğinden emindi. Yeni kurulan Gizli Servis, Birlik'in mali durumunu ciddi ölçüde tehdit eden enflasyon karşısında, başlangıçta sahte dolar basan kalpazanların peşine düşmüştü. Ülkede barışın sağlanmasının ardından ise, ilgisini güneyli içki kaçakçılarına yöneltti. Siyasi anlaşmazlıklar ile ilgilenmeye ise, 1871 yılında, "Radikal Yeniden Yapılanmacıların" görevlendirmesi üzerine başladı. Bu şekilde, ABD'nin casusları, özgürlükçü bir davaya destek sağlamak üzere görevlendirilmiş oldular.