Aliya İzzetbegoviç, siyasi kimliği ve komutanlığının yanı sıra, İslamı doğuya ve batıya hakiki bir üçüncü alternatif olarak en gerçek haliyle öneren birinci sınıf bir entellektüeldir. Bıraktığı düşünce mirası, her müslümanın üzerine tefekkür etmesi gereken bir mirastır.