1974 yılında İstanbul'da doğdu. İlk ve orta tahsilini İstanbul'da tamamladı. 1988 yılında Deniz Lisesi'ne giren Aydoğan Vatandaş, 1995 yılında Deniz Harp Okulu'ndan ayrıldı. 1995 yılında Aksiyon Dergisi'nde gazeteciliğe başlayan Vatandaş, 1997 yılında TİMAŞ yayınları arasında yayımlanan ve kısa süre sonra toplanan ilk kitabı "Armagedon/Türkiye İsrail Gizli Savaşı" ile dikkatleri çekti. 1997 yılında başladığı Fatih Üniversitesi İngiliz Dili ve Edebiyatı Bölümü’nden 2001 yılında mezun oldu. 1995-2000 yılları arasında Aksiyon Dergisi’nde muhabirlik, editörlük ve koşe yazarlığı yaptı. 2000-2004 yılları arasında Zaman Gazetesi’nde muhabirlik, editörlük ve köşe yazarlığı yapan yazar, 2002-2004 yılları arasında Karakutu Programının yapımcılığı ve sunuculuğunu üstlendi.
2006 yılından beri ABD New York’ta bulunan yazar, 2009-2011 yılları arasında Manhattan'da bulunan The New School'da Medya alanında master yaptı. Cihan Haber Ajansı New York Temsilcisi olarak görev yapan yazar, Today's Zaman Gazetesi'nde yoğun olarak Dış Politika ve haber-araştırma yazıları yazmaktadır. Yazar'ın gündem yaratan çok sayıda inceleme ve araştırma eseri bulunmaktadır.