Tabiatta bol miktarda bulunan restriksiyon enzimlerinin esas görevi, hücre DNA'sının virüslere karşı savunulmasıdır. Bunlar, hücreye giren yabancı DNA'yı farklı yerlerden keserler. Böylece, hücreye giren yabancı virüs DNA'sı etkisiz hale gelmiş olur.