Tarih-i Selaniki adlı eseri, 1563-1600 yılları arasındaki olayları içine alır. Eserinde saray törenleri, tayinler, aziller, mali sıkıntılar, kapıkulu askerlerinin isyanları anlatılır. Balkan illerinde doğup büyümüş, ayrıca bölgeye düzenlenen bazı seferlere eşlik etmiş, saraya en yakın kişilerin yanında ve sarayda kalarak olayları yakından izlemiş bir tarihçi olarak Osmanlı’nın bozulma dönmelerini gözlemleyebilmiş ve bunları eserinde anlatmıştır. “ Harameyn Mukataacılığı, Sipahiler Kâtipliği, Ruznâmecilik, Evkaf Muhasebeciliği gibi resmî görevler üstlenen Mustafa Selânikî, devlet çarkının çoğu kezneredeyse merkezinde bulunması nedeniyle, hem mevcut durumu doğrudan tetkik edebilme imkânını bulmuş hem de dönemin tanıkları ve resmî belgeler ışığında tarihini görece objektif bir yaklaşımla biçimlendirebilmiştir.