1951 Köyceğiz doğumlu olan Mehmet Akgün 1964 yılında Toparlar Köyü İlkokulu’nda ilkokul eğitimini tamamlamış, 1967 yılında Köyceğiz Naip Hüseyin Ortaokulu’ndan mezun olduktan sonra, 1971 yılında Muğla Turgut Reis Lisesi’ni bitirmiştir. Daha sonra Ankara Üniversitesi Dil ve Tarih-Coğrafya Fakültesi Felsefe Bölümünü kazanmış, 1976 yılında da lisans eğitimini tamamlamıştır.
Meslek hayatına 1977’de Erzurum Atatürk Üniversitesi Edebiyat Fakültesi Felsefe Bölümü’nde asistan olarak başlayan Mehmet Akgün, 1979’da Prof. Dr. Necati Öner’in danışmanlığında, “Tanzimat’tan Sonra Türkiye’de Türkçe Olarak Yayınlanan Telif ve Tercüme Felsefe Tarihleri” adlı, o dönemde yüksek lisans muadili olan doktora öncesi çalışmasını tamamlamıştır. Aynı yıl (1979) Erzurum Atatürk Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsünde doktora eğitimine başlamış ve Prof. Dr. Necati Öner’in danışmanlığında hazırladığı “Materyalizmin Türkiye’ye Girişi ve İlk Etkileri” adlı tezini vererek 1983’de doktor unvanını almıştır. 1983-1987 yılları arasında Arş. Gör. Dr. olarak akademik hayatına devam eden Akgün 1987’de Yrd. Doç. Dr. olmuş, 1987’de doçentliğini almıştır. 1995 yılında Pamukkale Üniversitesi’ne geçmiş ve bu üniversitede Felsefe Bölümü’nü kurmuştur. 1998 yılında profesör olan Mehmet Akgün, emekli oluncaya kadar (2018) Pamukkale Üniversitesi Fen Edebiyat Fakültesi Felsefe Bölümü’nün Bölüm Başkanlığı’nı yapmıştır.
Bölümümüzün kurucu Bölüm Başkanı olan Mehmet Akgün akademik hayatı boyunca birçok Yüksek Lisans ve Doktora öğrencisi yetiştirmiştir. 2018 yılı itibariyle 5 kitap, 22 makale, 27 kitap bölümü, 2 ansiklopedi maddesi ve 11 bildiriye imza atan Mehmet Akgün bölüm başkanlığı, enstitü müdürlüğü, yönetim kurulu üyeliği, dekanlık gibi birçok idari görev üstlenmiştir.