Kanuna karşı en şiddetli hücumlar bizzat Karabekir Paşa'dan geldi. Muhalefet lideri şöyle diyordu: "- İstiklal Mahkemeleri, adından da anlaşıldığı veçhile, İstiklal Harbi zamanına aitti. İsmet Paşa Hazretleri İstiklal Mahkemelerini ıslahat aleti zannediyorlarsa pek ziyade yanılıyorlar."