Papa, Rusya'ya XVI. asırdan beri Osmanlılara karşı Haçlı ittifaklarına almaya çalışıyordu. Fakat çarlar Osmanlı padişahına karşı açıkça mücadeleden daima kaçındılar.
Osmanlı Devleti Haçlı fikrinin mümessili olan imparatora ve Papa'ya karşı daima düşman bir siyaset gütmüş ve Avrupa'yı parçalanmış bir halde bulunduran kuvvetleri desteklemiştir.
1494'te Fransa Kralı VIII. Charles İtalya'yı istila edip Cem'i alarak Osmanlı Devleti'ne taarruz planları kurduğu zaman Osmanlılarla Venedik, Papa ve Napoli Krallığı arasında siyasi bir yakınlaşma oldu.
16 Temmuz 1922'de Kayseri Zincidere Manastırı'nda yapılan bir toplantıda Bağımsız Türk Ortodoks Patrikhanesinin kurulması kararlaştırılmıştır. 21 Eylül 1922'de de 72 ruhani merkez reisinin katıldığı bir kongreyle Bağımsız Türk Ortodoks Patrik- hanesi kurularak Papa Eftim patrik seçilmiştir. Patrikhane, ilk iş olarak Fener Rum Patrikhanesinin yalan propaganda faaliyetinde bulunduğuna ve Anadolu Hristiyanlarına Fener Patrikhanesinin zarar verdiğine dikkat çekmiştir. Türk Ortodoks Patriği seçilen Papa Eftim ve ailesi mübadeleden muaf tutulmuş; Eftim, adını Zeki Erenerol olarak değiştirmiştir.
Karamanlı Ortodoks Türkler, Millî Mücadele yıllarındaki tutumları ile de Rum Ortodokslardan ayrılmıştır. Rum Ortodokslarının Yunan Megali İdea programı dahilinde kendilerini Yunan saymaları ve Yunanistan ile birleşme faaliyetlerine Türk Ortodokslar katılmamışlar ve bu faaliyetleri protesto etmişlerdir. Türk Ortodoksların Millî Mücadele'ye destek veren çalışmalarının başını Papa Eftim (Pavli Karahisarlıoğlu) çekmiştir. Yozgat'ın Akdağmadeni ilçesinde doğan Papa Eftim, 1918'de Keskin Metropoliti olmuştur. Mondros Mütarekesi'nden sonra Fener Rum Patrikhanesinin tüm metropolitliklere gönderdiği Osmanlı Hükümeti ile ilişkilerin kesilmesi talimatına uymayarak Milli Mücadele'yi desteklemeye başlamıştır.