Tipik bir Y kromozomuna baktığınızda bir şeylerin döndüğünü anlarsınız. X kromozomu sekizinci en büyük kromozomdur, ancak Y sıkı bir çalışmaya hazır ve nazırdır. İçinde kompakt halde 60 milyon baz çifti bulunur ve yalnızca 86 gen içerir, ancak X kromozomunda etine dolgun 153 milyon baz çifti ve yaklaşık 2.000 gen bulunur. Üstelik bunlar birbirleriyle pek anlaşamaz;
X ve Y kromozomları öylesine uyumsuzdur ki, eşeyli üreme sırasında karışmazlar.