Ortak ataları bulmanın en çok kullanılan yollarından biri iki türün genetik kodlarını karşılaştırmaktır. Öncelikle mevcut mutasyonlar gözlemlenir ve ölçülür. Daha sonra genetik saat geriye alınır. Genetik fark miktarı iki türün ne kadar zaman önce farklı yollara girdiğini açıklar.