1967 yılında Sinop'un Boyabat ilçesinde doğan Mehmet Emin Maşalı, 1986’da Boyabat İmam Hatip Lisesi’ nden, 1993’ te Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi’ nden mezun oldu.
Marmara Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü’ nde 1996 yılında yüksek lisans yapan Maşalı, 2003 yılında Uludağ Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü’ nde doktora eğitimini tamamladı. Mehmet Emin Maşalı, 2011’de doçent, 2016'da Profesör oldu. Hâlen Marmara Üniversitesi İlahiyat Fakültesi Kur’anı Kerim Okuma ve Kıraat İlmi Anabilim Dalı öğretim üyesi olan Maşalı' nın kıraat ve tefsir alanlarında araştırmaları bulunmaktadır.
Prof. Dr. Mehmet Emin Maşalı, 15 Temmuz 2019 tarihinde yayımlanan Cumhurbaşkanlığı Kararnamesi ile İstanbul Müftüsü oldu.
Mürekkebi koy, kalemin ucunu düzelt, bâ'yı dik yap, sîn'i ayrık yaz, 'mîm'i kör kılma, 'Allah' lafzını güzel yaz, 'Rahmân' kelimesini uzat, 'Rahîm'i güzelce belirt, kalemi sol kulağına koy, zira bu senin için daha hatırlatıcıdır.