İç Savaşı, (Kardeşi Cem ile mücadele) rafiziliği, imparatorluğa karşı bir çok isyanı, depremleri veba salgınlarını atlatan Bayezıd, II. Murad II.Mehmed’in attığı temeller üzerinde, I. Selim ve Süleyman tarafından tamamlanan ve muhteşem bir şekilde süslenen sağlam bir yapının iskeletini kurdu.