Zayn Malik'in babası Pakistanlı Yaser Malik ve annesi İngiliz Trisha Malik'tir. Malik'in üç kız kardeşi var Doniya, Waliyha ve Safaa. Bradford'un East Bowling tarafında büyüdü. İlk okulda Lower Fields'a ve lisede Tong High School'a gitti. Zayn küçüklüğünü "Küçükken başa çıkılması zor biriydim. Biraz hiperaktiftim ki annem bile beni çocuk arabasında gezdirirdi." diye anlatıyor. Annesi de Zayn'i "Zayn bilgisayar başında şarkılara saatlerce eşlik ederdi." diye anlatıyor. Zayn Malik saçları yüzünden ilk iki okulundan atıldığını ama kız kardeşleri ile başka okula geçince uyum sağladığını söylemektedir. Üyesi olduğu One Direction grubundan 25 Mart 2015 tarihinde ayrılmıştır.
Bazen insanlar benden başka biri gibi davranmamı bekliyormuş hissine kapılıyorum, ama hayatımı bu şekilde yaşayamam. Kara gözlüklerin ardında yaşayan bir adam olamam ben; doğruyu söylemek, özgün olmak istiyorum.
Gençken, herkesin yaptığını yaparak uyum sağlamak önemli gibi görünüyor, ancak şimdi dik durup haklı davranmanın hiç de kötü bir şey olmadığını ve kişiliğimin bir parçası olduğunu fark ediyorum.