mtDNA’da sadece 16.500 baz çifti bulunur. mtDNA, maternel (anne tarafından) kalıtımla geçer.Spermin sitoplazma içermemesi ve mitokondrilerin döllenmeye katılmayan kuyruk kısmında toplanması nedeniyle zigot (anne ve babadan gelen eşey hücrelerinin birleşmesiyle oluşan yeni hücre) içinde sadece anneden gelen mtDNA vardır. Bu nedenle anne tarafından soyağacı araştırılmak istendiğinde mtDNA testi yapılır.