Hindistan’dan getirdikleri orduyla ingilizler Bağdat’ı ele geçirmişler, Musul’a doğru ilerliyorlardı. Filistin ve Suriye’ye saldırmak üzere Mısır’da bir ordu hazırlamaktaydılar. ilerlemeleri durdurulmalı, Bağdat geri alınmalıydı.
Alman Genel Kurmayı, Enver’in acil ricası üzerine, adına uygun düşecek “Yıldırım” gibi bir ordu kurmak üzere General von Falkenhein’ı yolladı. Yıldırım ordularının genel merkezi Halep’te olacaktı; bu ordular çok büyük ölçüde Alman subaylarıyla pekiştirilecekti. Mustafa Kemal, 7. Ordu’nun kumandanlığına atandı.
Fakat durumdan hoşnut değildi. Denetimin Almanlarda olmasını şiddetle protesto etti. Liman von Sanders’le çok iyi geçinmişti; fakat bu dik başlı, inatçı ama olağanüstü derecede yetenekli Türk’e nasıl davranacağını hiç bilemeyen von Falkenhein’le anlaşması olanaksızdı. Diğer yolları deneyip başarısız olan Alman, Mustafa Kemal’e armağan olarak altın paralarla dolu bir kutuyu gönderecek kadar budalaydı. Mustafa Kemal, kutu için resmi bir makbuz hazırlayıp gönderdikten sonra, altınları geri yollayıp makbuzunu da geri istedi.
Halep’teki ilk kurmay toplantısında Enver ve 4. Ordu kumandanı Cemal’le Mustafa Kemal, von Falkenhein ve birçok Alman subayı da hazır bulundu.
Mustafa Kemal eleştirel ve hırçın davranıyordu. Von Falkenhein’ın planlarını, özellikle de Bağdat’a yapılacak saldırı ile Süveyş Kanalı üzerine başlatılacak sefer hakkındaki planlarını hiç yerinde bulmuyordu. Her ikisinin de başarısızlığa uğrayacağına inanıyordu. Alman, Mustafa Kemal’in tutumu ve eleştirilerine içerlemişti. Almanlara düşman olan Cemal, burada Mustafa Kemal’e arka çıktı.
Anlaşmazlıklar öylesine sıklaştı ve derinleşti ki Mustafa Kemal kumandanlıktan istifa etti. Enver ve Falkenhein onu istifasını geri alması için ikna etmeye çalıştılar. Reddetti, hatta halefini belirleyerek, kumandasındaki orduya bu konuya ilişkin bir bildiri yayınlayacak kadar ileri gitti. Falkenhein, itaatsizliği yüzünden Mustafa Kemal’i cezalandırmak niyetindeydi; fakat Enver onu yeniden Diyarbekir’deki eski kumandanlığına atadı. Mustafa Kemal gitmeyi reddetti. Durumu kurtarmak ve disiplini korumak için, Enver, Mustafa Kemal’e süresiz hastalık izni verdi. Mustafa Kemal’in parası yoktu; Cemal onun atlarını satın alınca Mustafa Kemal İstanbul’a dönmek üzere trene binebildi.