DNA kendini kopyalamakta oldukça iyidir, ancak mükemmel değildir. Tıpkı hücrelerin her yeni oluşumunda olduğu gibi DNA da her kopyalandığında hatalar usulca içeri süzülür. Bu sürece bağlı olarak mitokondriyal DNAdaki haplotipler bile zamanla mutasyona uğrar. Değişim hızı rekombinasyonun her
nesil geçişinde babanın DNA’sı ile annenin DNAsını harmanladığı kromozomal DNA kadar yüksek değildir; ancak insanlık tarihinin yaklaşık 5.000 neslini geride bıraktığımızda bu mutasyon oldukça belirgin bir etki göstermiştir.