Neredeyse bütün diğer Türkler İslamiyet'i kabul ederken, Uygurlar farklı kültür ve dinlerini sonuna kadar korumuşlardı. Onuncu ve on üçüncü yüzyıllar arasında hemen batılarındaki Kaşgar'ı mesken tutan Türk hanedanı Karahanlıların, İslamiyet'i [yayma girişimlerine] karşı şiddetli ve başarılı bir direnç göstermişlerdi. Uygur hükümdarlığı on ikinci yüzyılın ortalarında Batı Liao Hanedanı'nın egemenliği altına girmiş, 1209'da da [Iduk Kut] Barçuk Art Tigin gönüllü olarak Cengiz Han'a baş eğmişti. Asilerin 1270'te Beşbalık'ı, 1284'te de Hoçu'yu ele geçirmesi Uygur hükümdarlığının sonunu getirmişti.