Mart 1963'teki Baas devrimi farklı bir sürecin başlangıcı oldu. Baas ile MK (Müslüman Kardeşler) ideolojisi uyuşmadı ve iniş çıkışlı bir ihtilaf dönemi başladı. Özellikle Halep ve Hama' da İslamcı aktivisitler örgütlenmeye ve yer altına inmeye başladılar. 1975'te Suriye'deki MK'nin başına Hama'lı Adnan Saad Al Din geçti. Onun liderliğindeki örgüt daha farklı organize oldu ve silahlı kanadı kuruldu. 1977-1982 arasında rejim MK'nin başını çektiği ayaklanmayla karşı karşıya kaldı. Önde gelen Nusayriler ve rejime bağlı diğer şahsiyetlerin hedef alındığı bir suikast kampanyası başladı. MK'nin eylemlerinden en ses getireni, 1979'da Halep'teki Askeri Topçu Akademisi'ne düzenlenen baskında 83 Nusayri Harp Okulu öğrencisinin öldürülmesiydi.