Hayatının son dönemlerinde Nietzsche yatalaktı ve gündelik yaşamını sürdürebilmesi için akrabalarının desteğine ihtiyaç duyuyordu. 25 Ağustos 1900'de 56 yaşındayken büyük ihtimalle ikinci bir felçten sonra zatürreden öldü. Ölümünün ardından herhangi bir kayıt tutulmadı ve otopsi hiç yapılmadı.