Kitabın ana temaları arasında dostluk, sevgi, kayıp ve hayal gücünün önemi yer alır. Küçük Prens'in dünyayı keşfederken karşılaştığı olgunluk ve saflık arasındaki zıtlık, okuyucuya derin düşünmeye sevk eder. Kitapta sık sık karşılaşılan "görmek için gözle değil, yürekle bakmak gerekir" gibi ifadeler, hayatta gerçekten değerli olanın ne olduğunu sorgulatır.