Bizde ilim ve inanç yan yana olmalıdır. Tek başına cami yaptırmak ya da ibadete açmak uygun değildir. Yanında bir de eğitim kurumu bulunmalıdır. İşte bu sebeple Ayasofya Camii'nin yanına yine Fatih'in emriyle bir de medrese inşa edilmiştir. Bu medresenin içinde bahsettiğimiz nice zat yanında Akşemseddin Hazretleri ile Ali Kuşçu gibi çok önemli isimler de ders okutmuşlardır. Ancak bu tarihi yapı, ''Ayasofya Camii tamir edilecek," denilerek ibadete kapatıldığı dönemde (1930-35) yıktırılmıştır