Osmanlı kaynaklarında dile gelen suçlamalar arasında öne çıkan en önemli iddia, dinler karşısında eşitlikçi tutumuyla ilgilidir. Şeyh Bedreddin bütün dinlerin özünde aynı olduğunu, aralarında bu itibarla bir fark bulunmadığını savunmaktadır. Varidat'ta bu düşünceyi açıkça görmek mümkündür. Bu anlayış, dönemin din alimleri tarafından İslamiyete hakaret olarak yorumlanmış ve idamına giden yolda geri dönülmez bir noktaya getirmiştir onu.