Leonardo bir tek kitabın, Doğa kitabının öğrencisidir. İncelemeleri büyük ölçüde insan bedeni üzerinde odaklanmıştır. Fakat bu incelemeler tüm doğa tarihi alanına kadar uzanmaktaydı; sürekli inceliyor, çiçek ve hayvan resimleri çiziyor ve bugün fiziksel coğrafya, mineraloji ve jeoloji olarak adlandırabileceğimiz konularda çalışıyordu. Rasyonel olarak fosilleri yorumlayan ilk bilim adamıdır.