"Yolu bilmekle o yolda yürümek arasında bir fark vardır." der bize Morpheus. Kâhin kendini takip edenleri yolu bildiğine inandırarak cesaretlendirip o yolda yürümelerinde yardımcı olur. Şayet durum buysa -şayet Kâhin'in önceden bilmesi gerçek değil de sadece bir görünüş ise- Neo hayatının kontrolünü elinde tutabilir ve her şeyin, mantık sınırları içinde, mümkün olduğu bir dünyada yaşayabilir.
Özgür olmanın anlamı kısmen birileri tarafından zorlanmamak ya da alıkoyulmamaktır. Eğer birileri sizi isteğiniz dışında bir şeyler yapmaya zorluyorsa ya da istediğiniz bir şeyi yapmanızı engelliyorsa özgür değilsinizdir.
Filmin temelinde yatan gerçek, bir cevaptır, bir soru değil. Bu, felsefenin en önemli sorularından birine verilen cevaptır: Zihnin doğası nedir? Film zihin ve kişisel kimlikle ilgili belli bir teorinin gerçeğine kesin gözüyle bakar. Bu görüş daha çok indirgemeci materyalizm olarak bilinir ve zihinsel durumların fiziki durumlara indirgenebileceğini savunur. Morpheus Matrix'i Neo'ya açıklarken bu görüşü özellikle tanımlar.