Balıkesir'in Dada Köyü’nde dünyaya geldi. İlkokulu aynı köyde bitirdikten sonra orta öğrenimini kendi ilçesinden tek kişi olarak kazandığı Savaştepe İlköğretmen Okulu’nda yaptı. Öğretmen Okulu 3.sınıfta 2 teksir kitap çıkardı; Savaştepe’nin yerel gazetesinde günlük aydınlatıcı yazılar yazdı. Başarısından dolayı Ankara Yüksek Öğretmen Okulu Hazırlık Lisesi’ne gönderildi ve buradan mezun olduktan sonra dışarıdan İlköğretmen Okulu’nu da bitirdi.
Öğretmen Okulu / Lise sonrası, önce İ.Ü. Veteriner Fakültesi’ne girdi. İki yıl bu
fakültede öğrenimini sürdürdükten sonra, tekrar üniversite sınavına girerek İstanbul Üniversitesi Cerrahpaşa Tıp Fakültesi’ne geçti ve 1980 yılında Cerrahpaşa Tıp Fakültesi’nden mezun oldu.
Bir süre İstanbul’da pratisyen hekim olarak çalıştıktan sonra Cerrahpaşa Tıp
Fakültesi Anatomi ve Klinik Anatomisi Kürsüsü’nde ANATOMİ ihtisasını yaparak
ANATOMİ UZMANI oldu.
Trakya Üniversitesi Tıp Fakültesi Anatomi Bilim Dalı’nda Uzman Doktor olarak görev yaptı; daha sonra aynı fakültede Yrd. Doç. Dr. ve DOÇENT Doktor olarak çalıştı.
Tekrar Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Anatomi Anabilim Dalına döndü. Burada teorik-
pratik anatomi öğretimine aktif katılım yanında bol kadavra olanakları nedeniyle T.Ü. Tıp Fakültesinde düşünüp gerçekleştiremediği birçok araştırmayı yürütmeyi başardı. 1996 yılında PROFESÖR oldu.
Mayıs 1993 yılında yayın hayatına başlayan MORFOLOJİ DERGİSİ’nin kurucu editörleri arasında yer aldı ve derginin sekreteryasını da yürüttü.
İdari görev olarak İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesinde Hastane Başhekimliği, Eğitimden Sorumlu Dekan Yardımcılığı ve Tıp Eğitimi Anabilim Dalı kurucu başkanlığı yaptı. Bu dönemde Cerrahpaşa Tıp Fakültesi’nin tam entegre programla eğitime geçişinde önemli katkılar sağladı. Bu katkılar, Cerrahpaşa Tıp Fakültesinin AKREDİTE olmasının yolunu açtı.
İ.Ü. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi’nde bir ilki gerçekleştirerek “Tıbbi Resim Birimi”ni kurdu. 2006 yılında kendi çizdiği anatomik resimler ile zengin anatomik kadavra disseksiyon fotoğraflarından örnekler içeren bir “Tıbbi Resim Sergisi” de açtı.
Son 20 yıldır anatomik resim çizim çalışmalarını arttıran Dr. Yıldırım 1800 civarında çizgisel resim ile varyasyonlar anatomisine yönelik yaklaşık 4000 kare fotoğraf içeren zengin bir kişisel arşive sahiptir.
Çalışmalarını öğrenci eğitimine yönelik kitaplar, medikal terminoloji, anatomik resim çizimleri, kadavraya dayalı varyasyonlar anatomisi ve Türklere özgü anatomik oluşum ölçümleri konularında yoğunlaştıran yazar Aralık 2022 itibariyle yerli – yabancı 120’nin üzerinde makale ve 50’ye yakın telif ve tercüme kitap/esere sahiptir.
2023 yılında, yaş haddinden emekli olacak olan Dr. Mehmet YILDIRIM halen İ.Ü.C. Cerrahpaşa Tıp Fakültesi Anatomi Anabilim Dalı’nda Öğretim Üyesi olarak görev yapmaktadır.
Evli olup, iki oğlu vardır.