Tarihî açıdan İslamofobi; Haçlılar, imparatorluk ve sömürgecilik dönemlerinde Hristiyanlık taraftarı ve Müslüman karşıtı özelliklere sahipti. Modern dönemde dinî özellikler seküler kavramlarla yani özgürlük, demokrasi ve küresel değerler fikirlerine odaklanmayla yer değiştirdi.