Transgenik bitkiler ise GDO teknolojisinin en hızlı ilerleyen ve gelişen dallarından biri olmuştur. İlk transgenik ya da genetiği değiştirilmiş ürün olan uzun raf ömürlü domates, "Flavr Savr TM" adı ile 1996 yılında pazara sürülmüştür. Bunu gen aktarılmış mısır, pamuk, kanola ve patates bitkileri izlemiştir.