Muhacirler, bir plan dahilinde daha önceden tespit edilen iskelelere bu
gemilerle taşınmışlardır. Muhacir sevkine tahsis edilen gemiler, muhacirleri
çıkardıkları iskelelerden dönüşlerinde "aşar malından zahire" getirmekteydiler. Yükleme ve boşaltma işlemi zaman kaybına sebep olması üzerine bu gemilerle yük taşınması yasaklanmıştır. Buna karşın Varna'ya mühimmat, erzak asker götüren beylik vapurlarının dönüşte muhacirleri ücretsiz taşımaları kararlaştırılmıştır.
Ecnebi kurupanyaların bulaşıcı ve salgın hastalığa yakalanmış muhacirleri
kabul etmemesi üzerine, asker sevkiyatına rağmen, Tersane-i Amire, İdare-i Mahsusa ve Şirket-i Hayriye 'ye ait bazı vapurlar muhacir sevkine tahsis edilmiştir. Özellikle, Şirket-i Hayriyye Idaresinin bu hususta zorluk çıkartması üzerine, II. Abdülhamid emir vererek her türlü kolaylığın gösterilmesini
istemiştir.