Bu Kirillos, kadın filozof ve cebir bilgini Hypatia'yı - Yunan matematik tarihindeki tek kadın- Müze'de verdiği konferantan döndüğü bir gün recmettirir. Söylenene göre Hypatia, bilge olmasının yanı sıra çok da güzeldi, fazlasıyla popülerdi ve Hıristiyan değildi. Dolayısıyla üstü başı kalabalık tarafından soyuldu, Okuyucu Petrus'un önüne kiliseye sürüklendi; istiridye kabuklarıyla canlı canlı kesildi ve tüm eserleriyle birlikte denize atıldı. Hypatia Mouseion'un son bilginlerinden biri olan, 380 yılında ölen matematikçi ve astronom Theon'un kızıydı. Kirillos ise aziz ilan edildi.