Köklü ilk olarak mesleğe Açık Radyo'da program ve yazarlarlığı yaparak başladı.
Latin Amerika dönüşü gazeteciliğe geçerek Hürriyet ve Radikal gazetelerinde muhabirlik ve editörlük yaptı.
Daha sonra Sabah gazetesinde çalışmaya başladı. 13 Şubat 2009'da greve çıkan ATV-Sabah çalışanlarından olan Nuh Köklü, o dönem Türkiye Gazeteciler Sendikası işyeri temsilcisiydi.
Köklü greve çıktıktan sonra işten çıkarılan 10 gazeteciden biriydi. Daha sonra NTV'de program editörü olarak çalıştı Mayıs2014'te işten çıkarılana kadar bu görevine devam etti.
Kadıköy'de arkadaşlarıyla kar topu oynarken bir esnafın dükkanının camının kırılması sonucu yaşanan arbede esnasında bıçaklanarak öldürüldü. Ölümünden sonra Kadıköyde anısına bir heykel dikilmiştir.