Beyin tabanı, beyin sapı da dahil olmak üzere, soluk almayı, kalp atışlarının hızını, uyku düzenini ve diğer temel bedensel işlevleri denetler. Beyin sapı, aynı zamanda kasların düzenli çalışmasını sağlayan yakınındaki beyincikle işbirliği içinde çalışır. Beyin sapı ve beyincik, neredeyse sıradan bir iguananın beyni gibi işlediklerinden, bazen birlikte sürüngen beyni olarak da anılırlar.