Çeşitli fiziksel koşullar insanları interseks hale getirebilir.
Sık görülen koşullardan bazıları şunlardır: Bazı insanlar XXY kromozomlarına sahiptir ve bunun sonucunda erkek genital leriyle doğarlar ama ergenlikte, memeler gibi bazı dişi ikincil karakteristikler geliştirirler. Diğer bazıları, XX kromozomla rıyla doğdukları halde rahimde aşırı derecede androjene ma ruz kalmalarından ötürü dişi iç genitalyaların yanı sıra belirsiz veya erkek dış genitalyalara da sahiptirler. XY kromozomlarına sahip bazı bireylerde ise androjen duyarsızlığı sendromu (AIS) mevcuttur. Bu kişiler, erkek iç genitallerine sahip oldukları hal de bedenleri, testislerinin ürettiği androjene yanıt vermez ve bu yüzden az ya da çok dişi dışsal genitaller ve dişi bir beden biçimi geliştirirler.