O dönemde Kutsal Engizisyon, yakmak veya hapsetmek üzere en özgür ve en cesur insanları seçmeye büyük bir özen göstermiştir. Yalnızca İspanya'da üç asır boyunca her yıl bin kişi öldürülmüş ve bu insanlardan bazıları toplumun en iyi bireylerinden -bunlar kuşku duyan ve sorgulayan bireylerdir, çünkü kuşku olmadan ilerleme de olamaz seçilmiştir.
Katolik Kilisesinin bu süreçte yol açtığı zararın haddi hesabı yoktur, ama bu zarar başka etkenlerle kısmen veya büyük ölçüde dengelenmiş ve Avrupa her şeye rağmen emsalsiz bir ilerleme kaydetmiştir.