Dolaşan kanda sürekli değişiklikler meydana gelir; örneğin, yemek öncesi ve sonrası glikoz miktarı hızla değişir, gün içerisinde kandaki hormon seviyeleri değişir, birçok biyokimyasal değişiklik gün boyu oluşur. Kandaki bu değişiklikler beyindeki nöronlar için fazla maceralıdır. Nöronlar macera sevmez. Onlar stabil bir biyokimyasal ortamda olmak ister. Bu yüzden kandaki dalgalanmaların beyne çok az yansıması gerekir. Kan-beyin bariyerinin amaçlarından biri bu dalgalanmalardan beyni korumaktır.